Ausgehend von der Zielstellung, der Benchmarking-Art und den Vergleichspartnern ist die Benchmarking-Organisation festzulegen. Hierbei sind Faktoren, wie die Wettbewerbsrelevanz oder die Kostenaufteilung unter den Vergleichspartnern zu berücksichtigen.
Folgende Organisationsformen sind realisierbar:
Immer wenn unterschiedliche Unternehmen zusammen kommen, ist die Einschaltung eines neutralen Koordinators anzuraten.




