Ausgehend von der Zielstellung, der Benchmarking-Art und den Vergleichspartnern ist die Benchmarking-Organisation festzulegen. Hierbei sind Faktoren, wie die Wettbewerbsrelevanz oder die Kostenaufteilung unter den Vergleichspartnern zu berücksichtigen.

Folgende Organisationsformen sind realisierbar:

Benchmarking-Organisation
Benchmarking-Organisation

Immer wenn unterschiedliche Unternehmen zusammen kommen, ist die Einschaltung eines neutralen Koordinators anzuraten.